MacMolPlt for Mac

Deskripsi

MacMolPlt adalah alat visualisasi Kimia yang dapat digunakan untuk membangun molekul dengan pembuat model grafis terintegrasi, membuat file input untuk program kimia komputasi GAMESS, dan kemudian memvisualisasikan hasil kimia komputasi berjalan. Fitur termasuk tampilan 3D berkualitas tinggi, animasi mode normal dan urutan reaksi dan output ke berbagai format termasuk gambar berkualitas tinggi dan film QuickTime dan Flash.

Input menggunakan: Format file MolPlt yang dilubangi oleh GAMESS dengan menempelkan koordinat Cartesian dari file log GAMESS atau Gaussian apa pun input GAMESS, file log atau irc File gaya Xmol XYZ File format MolDen File Protein Data Bank (pdb) Chemical Markup Language (CML) file Bangun secara grafis dengan editor molekul interaktif Bangun dengan tangan menggunakan koordinat internal gaya cartesian atau Z-Matrix Tampilan struktur 3D dan mode Normal Animasi mode Normal. Rotasi dan translasi real-time 3D di bawah kendali mouse Perhitungan parameter matriks-Z apa pun Secara visual mengukur/menampilkan jarak, sudut, dan dihedral. Pembuatan otomatis jalur Linear Least Motion (LLM) Perhitungan 2D dan 3D dan tampilan: Orbital molekul (AO's, MO's, atau LMO's) Total Electron Density Perbedaan Densitas Molecular Electrostatic Potentials (MEPMaps) Generator file input dasar untuk GAMESS OpenGL digunakan untuk high- kualitas rendering 3D Dukungan untuk simetri molekul Menghasilkan atom yang bergantung pada simetri Menentukan atom unik yang simetri Secara otomatis menentukan daftar grup titik yang didukung untuk satu set koordinat. Putar koordinat ke orientasi prinsip yang tepat Tampilkan operator simetri untuk banyak grup titik Output kualitas publikasi (warna atau hitam putih) melalui pencetakan langsung atau Salin dan Tempel ke Aplikasi lain. Output dalam berbagai bentuk termasuk Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies, dan film QuickTime.